# 科研技能清单（计算机科学与技术方向）

> 已安装 [Scientific Agent Skills](https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills)（163 个）至用户级技能目录，重启 ZCode 后生效。
> 本清单筛选出 **CS 科研常用**与**通用**技能，标注⭐为本毕设（端云协同编程智能体系统）直接可用。
> 未列出的约 100 个为生物/化学/医药/量子等领域专用技能，已安装但在 CS 方向大概率不会触发。

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## 一、文献与调研（选题/相关工作/开题）

| 技能 | 用途 | 备注 |
|---|---|---|
| literature-review | 多学术数据库系统性文献综述 | ⭐ 相关工作章节 |
| paper-lookup | 11 个学术 API 检索论文/预印本/引用 | ⭐ 快速找论文 |
| research-lookup | 为手稿汇编当前学术证据 | 写作时引用支撑 |
| citation-management | OpenAlex/PubMed/Google Scholar 引文管理 | ⭐ 参考文献格式 |
| bgpt-paper-search | 论文检索 + 全文实验数据提取 | |
| exa-search | 面向科学/技术内容的网络检索 | 需 Exa key |
| database-lookup | 公共数据库 API 规范查询 | |

## 二、实验设计与数据（评测/实验章节）

| 技能 | 用途 | 备注 |
|---|---|---|
| experimental-design | 数据收集前的实验设计（随机化/区组/样本量） | ⭐ 评测实验设计 |
| statistical-analysis | 统计检验选择/假设检验/效应量/APA 报告 | ⭐ 对比实验分析 |
| statistical-power | 样本量与统计功效计算 | 判断 200 条数据集是否够 |
| exploratory-data-analysis | 有界探索性数据分析（CSV/表格） | ⭐ 跑分数据初探 |
| scientific-critical-thinking | 评估实验设计与证据质量 | ⭐ 审自己的评测结论 |
| hypothesis-generation | 证据约束的科学假设生成 | |

## 三、机器学习与智能体（系统核心相关）

| 技能 | 用途 | 备注 |
|---|---|---|
| scikit-learn | 监督/无监督 ML 基线 | ⭐ 分类器/缓存预测基线 |
| pytorch-lightning | PyTorch 工程化训练 | ⭐ tier 线性头升级时 |
| transformers | HF 模型加载/推理 | ⭐ 本地小模型 |
| shap | ML 预测解释（SHAP） | ⭐ 分级决策可解释性 |
| stable-baselines3 | 强化学习算法（PPO/SAC/DQN） | agent 相关研究 |
| torch-geometric | 图神经网络 | 依赖图建模 |
| hugging-science | 科研领域 AI/ML 工作流 | |
| timesfm-forecasting | 时间序列零样本预测 | 负载预测类扩展 |

## 四、写作与呈现（论文/答辩）

| 技能 | 用途 | 备注 |
|---|---|---|
| scientific-writing | 论文草稿/修订/证据链审计 | ⭐ 毕业论文主体 |
| markdown-mermaid-writing | Markdown + Mermaid 架构图/流程图 | ⭐ 系统架构图 |
| scientific-visualization | 出版级科研图表（真实、无误导） | ⭐ 实验图表 |
| scientific-slides | 答辩/组会幻灯片 | ⭐ 答辩 PPT |
| scientific-schematics | AI 生成科研示意图 | 系统示意图 |
| peer-review | 同行评审级稿件评估 | ⭐ 交稿前自审 |
| venue-templates | 期刊/会议/海报模板 | |
| latex-posters | LaTeX 学术海报 | |

## 五、通用工具（日常科研）

| 技能 | 用途 | 备注 |
|---|---|---|
| pdf | PDF 读取/拆分/合并/提取 | ⭐ 读文献 PDF |
| markitdown / liteparse | 文档/PDF → Markdown | ⭐ 喂给 LLM 前的格式转换 |
| docx / xlsx / pptx | Office 三件套读写 | ⭐ 任务书/中期表 |
| matplotlib / seaborn | 绘图基础库 | ⭐ |
| sympy | 符号数学（公式推导验证） | 复杂度分析 |
| networkx | 图/网络分析建模 | |
| polars / dask | 大表数据处理/分布式 | 评测数据量大时 |
| infographics | AI 信息图生成 | 汇报配图 |
| generate-image | AI 生图/改图 | |
| what-if-oracle | 结构化 What-If 情景分析 | 方案论证 |
| scientific-brainstorming | 证据感知的科学头脑风暴 | 选题/方案发散 |

## 六、系统/环境（需要时）

| 技能 | 用途 |
|---|---|
| optimize-for-gpu | NVIDIA GPU 加速科学 Python（一致性校验） |
| modal | 无服务器云算力跑 Python（重负载时） |
| get-available-resources | 探测宿主机 CPU/内存/磁盘/GPU 清单 |
| matlab | MATLAB/Octave 数值工作流（如课程需要） |

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## 未列入的方向专用技能（已安装，按需查阅）

生物信息（biopython/scanpy/pysam 等 ~40 个）、化学与药物（rdkit/deepchem/medchem 等 ~20 个）、
临床与医疗（pyhealth/clinical-* 等 ~15 个）、量子计算（qiskit/pennylane/qutip）、
地理（geopandas/geomaster）、实验室自动化（pylabrobot/opentrons）等。
完整清单：`~/.agents/skills/` 目录，或用 `find-skills` 技能按需检索。

## 生效说明

技能在 **ZCode 会话启动时**扫描加载——重启会话后即可在对话中直接触发
（如"用 statistical-analysis 分析这份评测数据"），无需手动安装依赖（用到时按技能内指引装）。